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Institut für Organismische und Molekulare Evolutionsbiologie (iOME)

Fachbereich Biologie

Johannes Gutenberg Universität Mainz

AG Molekulargenetik & Genomanalyse

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Die AG ist im Jahre 2017 aus dem ursprünglich 1994 gegründeten Institut für Molekulargenetik, gentechnologische Sicherheitsforschung und Beratung (IMSB) hervorgegangen.

Ihre gegenwärtigen Forschungsaktivitäten umfassen:

• Funktionsanalyse und molekulare Evolution der Globin-Genfamilie
• Genomanalyse und Genregulation bei Hypoxie-toleranten, krebs- und alterungsresistenten Nagetieren

• Bedeutung von repetitiver „Junk DNA“ in der Evolution von Genomen und Chromosomen bei Insekten

• Genomsequenzierung und molekulare Phylogenomik weitgehend unerforschter Tierstämme (Rotifera, Acanthocephala)

• Entwicklung von Methoden für die Artendiagnostik in Nahrungsmitteln durch Next-Generation-Sequencing („All-Food-Seq“)

Themen der AG Prof. Schmidt (pensioniert; ehem. Institut für Molekulargenetik) sind:

• Molekulare Analyse des Kolumnarwachstums von Apfelbäumen
• Genomanalyse der geschlechtsbestimmenden DNA-Region bei Insekten (mit Dr. Christiane Kraemer)

Neben universitären Forschungs- und Lehraufgaben führt die AG Untersuchungen im Bereich der Überwachung gentechnischer Anlagen im Auftrag und in Zusammenarbeit mit den zuständigen Behörden durch. Die AG ist an der Entwicklung und Evaluierung von amtlichen §64-Methoden zum Nachweis von Tier- und Pflanzenarten sowie von gentechnisch veränderten Produkten im Lebensmittelbereich beteiligt. Mitarbeiter der AG sind in der Fortbildung von Projektleitern in Genlaboratorien und in der Strahlenbiologie als Referenten engagiert.

Darüber hinaus bietet die AG zusammen mit der „NGS Core Unit“ einen umfangreichen Service in der Nukleinsäureanalytik und Genomforschung an:

• Hochdurchsatz-DNA-Sequenzierung (Illumina-NGS mit HiSeq 2500; Zugang zu MiSeq/NextSeq-Plattformen; Library-Herstellung für RNA-Seq, ChiP-Seq, Exome-Seq, DNA-Seq)

Kontakt NGS-Core Unit: Dr. Christiane Kraemer (Email: ckraemer@uni-mainz.de)

• Hybridisierungstechniken (z.B. FISH; Isotopenlabor vorhanden)

• DNA-Qualitätsprüfung (Qubit, Bioanalyzer, Qiaxcel)

• DNA-Klonierung (z.B. Genbanken)

• PCR-Methoden (z.B. Real-Time PCR)

• Bioinformatik (z.B. Genomannotation, de novo-Genomassemblierung, RNA-Seq, Molekulare Phylogenie)

Informationen und Material zu Lehrveranstaltungen

• MSc-Modul 7A/B „Genomforschung und Sequenzanalyse“ (AG Hankeln)

Nächster Termin Teil 7A im Nov. 2020 (Anmeldung per JOGUstine); Teil 7B: Dez 2020-Juli 2021 (nach Vereinbarung)

PDFs zur Modul 7A-Vorlesung "Genomforschung und Sequenzanalyse" (T. Hankeln)
(1)(2)(3)( 4) (5)(6)(7)(8)(9)(10)(11) (12) Seq-Testfile zu VL1

Ergänzende PDFs zum MSc-Modul 7A (F1-Praktikum „Genomforschung und Sequenzanalyse“)

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PDFs zur ergänzenden Vorlesung „Molekulare Evolution von Genen und Genomen“ (T. Hankeln)

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• BSc-Modul 13/14 „Analyse von Eukaryotengenen“ (AG Hankeln).

Nächster Termin: 02.03.– 20.03. 2020, ganztags, 3-wöchig, inkl VL und Seminar (Anmeldung per JOGUstine)

PDFs per READER-Plattform verfügbar

• BSc-Modul 13/14 „Molekulargenetik der Eukaryoten“ (Hankeln, Kraemer).

Nächster Termin: pending, Durchführung halbtags (Anmeldung per JOGUstine)

• BSc-Modul 8 Grundvorlesung & Grundpraktikum „Allgemeine und Molekulare Genetik“ (Vers. 2019)

PDFs zur Grundvorlesung: DNA Chromatin Replikation Genexpression-Transkription-EU Genregulation-Pro Genregulation-EU Gentechnologie

PDFs zum Grundpraktikum: (Kurstag Chromosomen) (Kurstag DNA) (Kurstag Gentechnologie 1) (Kurstag Gentechnologie 2 )

• BSc MolBio Modul 4-2 „Bioinformatik und Biostatistik“

PDF zur Vorlesung , Teil Hankeln (A) (B) (Vers. 2019)

• PDF „Strahlenbiologie“ (T. Hankeln) VL Strahlenbiologie: PDF

• PDFs „Projektleiter Gentechnik“ (T. Hankeln) (1) (2) (Vers. 2020)

Kontakt

Institut für Organismische und Molekulare Evolutionsbiologie

AG Molekulargenetik und Genomanalyse
J.-J. Becherweg 30A
Johannes Gutenberg-Universität

D-55128 Mainz

Prof. Dr. Thomas Hankeln
Tel.: +49 6131 39 23277
Fax: +49 6131 39 24585
email: hankeln@uni-mainz.de

Sekretariat Prof. Hankeln (Sprechzeit für Studierende Do 10-12.00 Uhr oder n.V.):
Frau Sonja Lebert
email: lebert@uni-mainz.de
Tel. +49 6131 39 26618

Prof. Dr. Erwin R. Schmidt (pens.)

(ehem. Institut für Molekulargenetik, gentechnologische Sicherheitsforschung und Beratung)
email: eschmidt@uni-mainz.de

Tel.: +49 6131 39 25346

letzte Änderung: Di 10.03.20 16:00 Uhr TH